1）接单
报检操作人员接到客户或内部转来的单据后，在专门的登记薄上登记，有特殊要求的应注明，并询问出口的大致日期，出口运输方式是否需要出具检疫部门的证书等。
2）审单
首先要核对出口报检单据是否齐全。单据有：发票、装箱单、合同、报检委托书；出口安全质量许可、食品卫生监督等管理范围之内的商品，必须提供生产厂家的两证管理编号以及厂检合格单等；出口熏蒸货物必须提供场站入货通知书，并且确认货物存放于场站熏蒸区。
3）预录
（1）出口单据审核完毕后，使用单证系统对单据进行预录入。预录入过程中，可以根据系统提示制单，并且可以根据系统对商品编码的要求终确认所需单据是否齐全。
（2）在制单过程中出现计量单位与海关的计量单位冲突时，计量单位按商检规定的计量单位输入，第二计量单位按海关的规定输入。
（3）在制单预录入的过程中如果出现问题应及时与客户或操作人员联系。
（4）一般在预录入后待系统自动生成预录入报检编号后，打印报检出境货物报检单，交给报检员。
4）申报
（1）报检员在接到全套申报单据发票、装箱单、合同、报检委托书、有特殊要求的其他单据后，在报验申请单上填写随附单据并注明，报检员签名。
（2）到报检前台申报，随时解答商检官员对商品的提问，报检员必须对所申报商品及客户情况有所了解。
（3）申报完成，报检员根据申报货物的不同，将申报单据转往各个科室，并且根据各个科室的不同要求对单据进行登记。
5）验货
（1）申报完毕的单据，报检员要及时联系客户验货，到检疫局科室预约验货时间并告知客户。
（2）验货完毕后将单据转回各科室。
6）放行
（1）出口验货后到科室将验货单据找出，根据科室要求不同填写验货单据交科室主管人员签字，并在电脑中过机放行。
（2）到计费处计费，然后到商检财务缴纳检疫费。
（3）打印《出口货物通关单》，如果需要出具检疫部门证书的，还需在单据中注明，以便日后出具检疫证书。
（4）放行后将通关单交给报检操作人员或报关人员签收。
7）下帐
（1）报检员将出口通关单及商检发票交给操作人员，操作人员将其复印登记留底，并注明公司编号。
（2）将正本通关单交给报关员报关使用。
