杀菌锅从控制方式上分有四种
1、手动控制型：所有阀门和水泵均由手动控制，包括加水、升温、保温、降温等工序。
2、电气半自动控制型：压力由电接点压力表控制，温度由传感器（pt100）和进口温控仪控制（精度为±1℃），降温过程由人工操作。
3、电脑半自动控制型:采用PLC和文本显示器将采集的压力传感器信号和温度信号进行处理，卧式杀菌锅，可以储存杀菌工艺，控制精度高，温控可达±0.3℃。
4、电脑全自动控制型：全部过程都有PLC和触摸屏控制，三锅并联杀菌锅，可以储存杀菌工艺，操作工只需按启动按钮即可，杀菌完毕后自动报警，温控精度可达±0.1℃。
杀菌锅可以根据产量进行选择。我们一般是根据产量/每小时进行计算。产量不是很高就选择用单锅、卧式双层杀菌锅。产量高就可以选择双锅并联或者双锅带罐杀菌锅。设备并不是越贵越好，也不是功能越杂越好。也不是越大越好。适合自己的的才是好的。
也可以根据场地大小进行选择。尤其是双锅带罐的杀菌锅。如果场地较窄，东莞杀菌锅，但是层高，就可以选择上罐杀菌锅。如果场地宽阔但是层高较矮，就可以选择后罐杀菌锅。卧式双层的杀菌锅，也可以根据需求做成框架可拆卸式。方便以后的使用。
蒸汽杀菌锅的相关操作步骤流程：
1)准备：首先将内层桶取出，再向外层锅内加入适量的水，使水面与三角搁架相平为宜。一般来说每次前都应该加水。加水不能太少，否则会引起烧干或者爆裂。加水好加去离子水或蒸馏水，这样产生的水垢少些，而且锅体不容易被腐蚀。
2）放回桶，并装入待物品。将准备的培养基及空玻璃器皿用牛皮纸包好，装入锅内套层中，物品放置不宜过多，过挤，锅内应留出三分之一空间。以免防碍蒸汽流通而影响效果。三角烧瓶与试管口端均不要与桶壁接触，以免冷凝水淋湿包口的纸而透入棉塞。
3）加盖，并将盖上的排气软管插入内层桶的排气槽内。然后盖严锅盖，采用对角式均匀拧紧锅盖上的螺栓，使螺栓松紧一致，勿使漏气。
4）用电炉或煤气加热，并同时打开排气阀，使水沸腾以排除锅内的冷空气。待冷空气完全排尽后，关上排气阀，巴氏杀菌锅，让锅内的温度随蒸汽压力增加而逐渐上升。当锅内压力升到所需压力时，控制热源，维持压力至所需时间（在温度或者压力达到所需时，一般为121℃，0.1MPa）需要切断电源），停止加热。当温度下降时，再开启电源开始加热，使温度维持在恒定的范围之内。
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